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早在2007年,为女坐落Urbana-Champaign的美国伊利诺伊大学的研讨人员就使用了英伟达的GPU产品用于核算生物分子、为女离子的彼此作用,结果是运算速度比过去选用CPU集群提高了100倍。分子动力学(MolecularDynamics,斯里生新简称MD)分是一种开展了几十年的核算机模仿实验办法,斯里生新它根据经典力学原理,特别是牛顿运动定律,来追寻和猜测很多粒子(如原子和分子)在给定条件下的运动和彼此作用。在这一年,恐袭美国D.E.Shaw研讨所发布了超级核算机安腾第二代,恐袭可以完成在微秒至毫秒级时刻段内对蛋白质动态运动的模仿,相当于捕捉到蛋白质运动的动态影片。
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超级核算机安腾的软硬件规划专为分子动力学加快而生,斯里生新从硬件层面的芯片、斯里生新主板、布线,到软件层面的专用软件Desmond的开发,均是由D.E.Shaw研讨所特别规划的。
2020年3月,恐袭D.E.Shaw研讨所公开了对新冠病毒3CL蛋白酶长达100微秒的分子动力学模仿动画及相关数据,恐袭这为科研人员深化了解新冠病毒的生命周期内涵机制以及研制针对性的3CL蛋白酶抑制剂供给了极为宝贵的理论支撑。共有来自15个国家和地区的12000名跑者取得参赛资历,袭击性年纪最大70岁,最小16岁,30余家跑团参加其间。
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